Automatic Fiducial Detection

Automatic Fiducial Detection, acik kaynak kütüphaneleriyle gelistirilmis, morfoloji algoritmalari yardimiyla, amleyiat öncesi cekilen radyoloji resimlerinde bulunan üc boyutlu (3D) objeleri (titanyum küre), girilen obje özelliklerini degerlendirerek yinelemeli sekilde, ortaya cikaran, tanimlayan, open4Dnav icin yazilmis bir tool’dür.

Amac
Projenin amaci cerrahi operasyondan önce, bilgisayarli tomografi (CT) resimleriyle hastanin kayitlanmasindaki kullanici hatasini ortadan kaldirarak, amleiyat öncesi operasyon bölgesi yakinina yerlestirilen titanyum küreleri bilgisayarli tomografi resimlerinde tanima/ortaya cikartma, kütle merkezlerini, lokasyonlarini ve birbirleriyle iliskilerini hesaplama islemlerini otomatik gerceklestiren bir algoritma gelistirmektir.

Automatic Fiducial Detection Tool’ü aranan objeleri arka planda yedi adimda tanimlamaya olanak saglar. Ilk olarak kullanici yardimiyla bir defaya mahsus, 3D coklu düzlem CT resimlerinde calisma alani  “Region of Interest (ROI), Ilgilenilen Alan” belirlenir. Bu alanin icinde aranan objelerin bulunmasi ve ROI yardimiyla algortmanin calisma süresi kisaltilir. Ikinci asamada, daha sonra obje tanima, lokasyon ve objelerin geometrik özellikleri ölcümlerini belirlemek amaciyla esikleme yöntemiyle 3D ikili (binary) bir resim olusturulur. Segmentasyondan sonra, diger adim olan morfoloji isleminde kullanilmak üzere, aranan objelerin yaricapi degerinde 3D bir küre olusturulur. Dördüncü asamada ham, dijital resimdeki objerle, olusuturulan kürenin birbiriyle uyumunu belirlemek icin daha önce olusturulan küre, morfoloji acma algoritmasi yöntemiyle dijital resmin üzerine uygulanir. Istenmeyen objelerin elimine edilmesi isleminden sonra morfoloji asamasinda elde edilen resme geometri-filtersi uygulanarak, aciga cikartilan objelerin, kartezyen koordinat sisteminde kütle merkezleri,  büyük/kücük eksen uzunluklari, taninan objelerin sayisi, uzanim, dismerkezlik, vs. gibi geometrik özellikleri hesaplanir. Altinci adimda bulunan, yerleri belirlenen objelerin geometrik özelliklerine dayanilarak, birbirleriyle iliskilerini simule eden ve gösteren; örnegin yerleri belirlenen objelerin aralarindaki uzakliklari belirten, uzaklik haritasi cizilir. Sürec sonunda tanimlanan objeler segmentasyonla 3D resim olarak görsellestirilir.

Ekran görüntüleri

Daha detayli bilgi Indirmeler ve Makaleler sayfasinda bulunabilir.

Y. Özbek, W. Freysinger