AROSCOPE

Bu projede, optik takipci aleti (NDI Optotrak Certus) yardimiyla amac dogrultusunda gelisitirlmis ve takipciyle intraoperatif izlenen stereo cerrahi mikroskop (Leica M500-N) kullanilarak artirilmis gerceklik (AG) uygulama calismasi gerceklestirilmistir. Proje (AROSCOPE – Stereo Augmented Reality in a Navigated Surgical Microscope), platform bagimsiz acik kaynak kodlu kütüphaneleri kullanarak, medikal uygulama konsepti gelistirilmesini icermektedir. Stereo cerrahi mikroskopla yapilan ameliyatlar icin nirengi noktalari kullanilarak...
daha fazla

CTK in CAS

CTK in CAS (The Common Toolkit in computer assisted surgery) yüksek verimli, modüler ve eklenti tabanli biyomedikal uygulamalari gelistirmede kullanilan, CTK eklenti altyapisinin bilgisayar destekli cerrahide örnegin standart navigasyonda sablon olarak kullanilmasini saglayan acik kaynak kodlu tibbi bir yazilim ve klavuzdur. Amac Projenin amaci ilk olarak CTK eklenti altyapisi yardimiyla biyomedikal alanda bircok anlamda örnegin kodlama ve yönetim, karmasik uygulamalarin yapilmasini kolaylastiran ve sadelestiren bir sablon (tanitim uygulamasi)...
daha fazla

Automatic Fiducial Detection

Automatic Fiducial Detection, acik kaynak kütüphaneleriyle gelistirilmis, morfoloji algoritmalari yardimiyla, amleyiat öncesi cekilen radyoloji resimlerinde bulunan üc boyutlu (3D) objeleri (titanyum küre), girilen obje özelliklerini degerlendirerek yinelemeli sekilde, ortaya cikaran, tanimlayan, open4Dnav icin yazilmis bir tool’dür. Amac Projenin amaci cerrahi operasyondan önce, bilgisayarli tomografi (CT) resimleriyle hastanin kayitlanmasindaki kullanici hatasini ortadan kaldirarak, amleiyat öncesi operasyon bölgesi yakinina yerlestirilen...
daha fazla

StoS

StoS (Surface to Surface), Iterative Closest Point Algoritmasi (ICP) yardimiyla yüzeye dayali (modele dayali) kayitlama, eslestirme yapabilen open4Dnav icin yazilmis acik kaynak kodlu tibbi bir tool‘dür. Projenin amaci ilk asamada ilerde ICP‘de referans nokta kümesi olarak kullanilacak, bilgisayar tomogrofisi (CT) serisinden segmentasyon yapilmis üc boyutlu bir modeli yüzey cikartim (surface extraction) yardimiyla kartezyen koordinat sistemli bir nokta kümesinin (point cloud) elde edilmesidir. Ilerde hedef nokta kümesi olarak kullanilacak...
daha fazla

ViSeCut

ViSeCut, DICOM formatintaki iki boyutlu (2D) bilgisayar tomogrofisi (CT) resimlerini inceleme, isleme ve segmentasyon gibi özelliklere sahip, okunan resimleri degisik resim isleme teknikleri, metodlari ve algoritmalarlayla (volume rendering, watershed segmentasyonu ve region-growing segmentasyonu) isleyen, görüntüleyen, analiz eden ve istenilen sonuclari ortaya koyan acik kaynak kodlu tibbi bir yazilimdir. ViSeCut, Linux(Fedora 10) isletim sisteminde gelistirilmis olup, gerekli acik kaynak kodlu tibbi kütüphanelerin entegre edilmesiyle Windows,...
daha fazla

CTTranslator

CTTranslator, DICOM formatintaki iki boyutlu (2D) bilgisayar tomogrofisi (CT) resimlerini inceleme, isleme ve  marching cube algoritmasi yardimiyla segmentasyon, sayisal alanlarda cok köseli yüzey hesaplamasi (isosurface) gibi özelliklere sahip, okunan resimleri degisik resim isleme teknikleri ve metodlari (hounsfield skala) isleyen, görüntüleyen ve istenilen sonuclari ortaya koyan  acik kaynak kodlu tibbi bir yazilimdir. CTTranslator, Linux (Fedora 10) isletim sisteminde gelistirilmis olup, gerekli acik kaynak kodlu tibbi kütüphanelerin...
daha fazla

GantryTilt0

GantryTilt0, gantry egimine sahip DICOM formatintaki iki boyutlu (2D) bilgisayar tomogrofisi (CT)  resimlerini degisik acilardan(axial, sagittal, coronal) görüntüleme, Affine transformasyon-kesme fonksiyonu (Shear-effect) kullanarak gantry egimini sifirlama ve bu islemlerden sonra tekrar 2D seri resimler olarak kaydedilmesini saglayan acik kaynak kodlu tibbi bir yazilimdir. Projenin amaci -6° (shear factor) gantry egimli CT resimlerinin okunmasi, görüntülenen resimlerin üc boyutlu kartezyen koordinat sisteminde Affine transformasyon yardimiyla...
daha fazla

mimimiC

mimimiC C programlama diliyle gelistirilmis yine c dilinde yazilmis olan okudugu kaynak kodunu analiz eden, derleyen ve calistiran bir derleyicidir. Projenin amaci C dilinde bir derleyici gelistirilmesi ve kodlanmasidir. mimimiC sadece C de yazilmis olan kaynak kodunu  kabul eden, C yazilim dilinin bir cok özelliklerini bünyesinde barindiran ve bünyesinde barindirdigi islemler icin kabul eden, sanal makine (virtual machine) icin RISC kodu üreten cok pasolu (native multipass) derleyicidir. mimimiC Linux (Debian) isletim sistemiyle gelistiriplmis...
daha fazla